促进出苗
为了促进辣椒种子尽快出苗，出苗前苗床要维持较高的湿度和温度，种子破土出苗后，为防止徒长，床温要逐渐下降，降温的程度应不妨碍幼苗生长。辣椒宜把温床降到白天20-25℃、夜间12-18℃，直到第一片真叶露尖时。
低温炼苗
幼苗经过低温锻炼，可以增强抗寒性和抗病性，使幼苗组织充实，胚茎粗壮，提早出蕾。因此，12月以前播种的辣椒，出苗时气候还比较温暖，为了做好对幼苗的低温锻炼，晴天要格外注意通风降温，中午气温在15℃以上时，都可揭窗、揭膜；夜间气温在5-10℃以上不要盖草帘。如播种迟出苗时已在严寒季节床温已经偏低了，则不必强调低温锻炼。进行低温锻炼时床温要逐渐降低，使幼苗有一个适应低温的过程。若原来的床温较高，突然把温度降低很多，往往使幼苗受害。第一片真叶露尖后，床温恢复到幼苗正常生长温度。（辣椒苗床白天20-25℃，夜间温度宜在12-18℃）
光照控制
种子发芽刚钻出土地的嫩芽是白色，接受阳光后很快转变成绿色，但这时原先种子内储藏的养分已经耗尽，幼苗本身制造养分的能力很弱，为了制造营养物质，增强幼苗的抗性，应增加光照，促进幼苗的光合作用。为了使苗床多照阳光，在幼苗能适应的温度范围内，白天尽量提早揭除草帘，傍晚尽量延迟覆盖草帘。玻璃和塑料膜要经常揩刷干净，注意通风，防止在塑料膜上凝有水珠。在温度较高的晴天，若温度允许，应多开玻璃窗子和揭膜，让阳光直接射入。
湿度控制
苗床土壤湿度大，水分充满土中的空隙会妨碍根的呼吸作用，影响根的生长。宁外，湿度高的土壤，温度不易升高。土温低，湿度高的环境，对根的影响很大，容易造成弱苗。此外，床内空气中湿度过高，影响幼苗蒸腾作用，使幼苗不能健壮生长，有利于原菌的繁殖，抗病性下降，易发生病害。
通风管理
通风可降低苗床的相对湿度。随着床内和床外的空气的不断的交换，苗床内的湿度更逐渐降低了，阴天或太阳才升起不久，只需少量通风，晴天、中午前后气温高，无风可把窗户膜全部揭开，阴雨天，外面空气湿度大，不能靠通风来降低温度，可以适当采取撒干土的办法，通过在苗床上撒一层干土，可以吸收一部分水分来降低湿度。
土壤管理
幼苗出土后不久应及时松土，是床土的表层疏松，防止板结，减少水分蒸发，保持床土温度，此外松土还有利于土中二氧化碳气体排出，氧气进入土中，增强根的吸收作用，松土时常用竹签把苗间表土撬松，或用铁钉、铅丝等制成的小耙把苗间的表土抓松，松土不可过深，避免损伤根系。傍晚苗床高湿对幼苗生长不利，但湿度太低也不好，因为幼苗光合作用，蒸腾作用和其它生理活动都需要水，土中的肥料养分也需要溶解到水里才能被根吸收，所以床土过干秧苗得不到足够的水分，生长受抑制，往往成为僵苗，因此在苗床土壤干燥时应抓住时机浇水，浇水时间应选在晴天的上午10到12时之间，因此正是一天中温度最高的时刻，使浇水而造成降低的床温容易回升。比外中午前后温度高，还便于苗床通风，使淋在秧苗上的水滴蒸发掉，防止发生病害。
水份管理
傍晚不能浇水，这是由于浇水后入夜，气温逐渐降低，一来床温不能回升，二来夜间苗床一般要关窗保温，浇水是时淋在秧苗茎叶上的水滴不能蒸发掉，夜间随着床温的降低，床内空气的相对湿度增高，使秧苗的茎叶更加湿润，在茎叶表面潮湿和有水滴的情况下，病菌容易侵入秧苗。因此降雨前或寒流来临时不能浇水也是这个道理苗床浇水，最怕水量过多，造成床土湿度过大。但浇水量也不宜过少，倘若水分没有渗到秧苗根系所在的土层中，则达不到浇水的目的，因此应采用“少浇勤浇”的办法，合理的浇水量是水渗下后，秧苗根系周围的土壤湿润，床土表层湿度较小为好。
肥水管理
苗床施肥应以基肥为主，控制追肥，特别是假植以前一般不追肥。但床土不够肥沃，秧苗出现缺肥症状时应及时追肥，追肥与浇水一样，要选在晴天无风的上午10到12时进行，以有机肥和复合肥为主，若用人、畜粪尿作追肥，必须是充分腐熟的陈粪，不能用新鲜的，并要把粪渣滤掉浓度，以10到12倍水稀释较好，淋在秧苗茎叶上的粪液，要立即用清水冲掉，否则会引起焦叶，易生病。所以浇粪时最好两人配合，前面一人浇粪、后面一人跟着洒水，把秧苗茎叶淋洗干净，浇粪后必须开窗、揭膜通风，这不仅是为了使淋湿的秧苗茎叶蒸发干，还为了排出氨和硫化氢等气体，避免秧苗受毒害。为减轻追肥与控制床土温度的矛盾，一般追肥与浇水结合进行，在有阴雨或寒流即将来临时，也不可追肥。
间苗管控
为了不让秧苗拥挤，各秧苗间互相遮阴，造成高脚苗，应及时间苗（删苗）。一般于齐苗时进行间苗，把密集的、受伤的、畸形的、顶壳的苗和病苗拔掉，出苗过迟生长矮小的苗和出苗过早趋向徒长的苗都是间苗的对象。间苗后若床土较干，可浇些水，使苗的根部与土壤密切接触，易吸收水分和养分，若床土较湿，不可浇水，可在土面撒一层疏松的细土。
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