辣椒苗期可进一步细分为出苗期、子苗期、小苗期和成苗期，各阶段的水分管理重点各有不同，所以川椒种业提醒广大种植户需要根据幼苗生长进程灵活掌握。
1. 出苗前：保障水分，促发整齐
播种前，苗床应浇足底水，使基质或土壤充分湿润。播种后覆盖地膜或遮阳网进行保湿，保持苗床高湿度，促使种子快速发芽。播种用水应避免使用污水、脏水，最好采用干净的地下水。
2. 出苗至子苗期：控水降湿，防徒长防病害
幼苗出土到第一片真叶顶心为子苗期。此阶段胚轴最易徒长，形成“长脖苗”。辣椒播种出齐后，应在降温的同时严格控制水分。可在苗床上撒些细干土，既能保墒又能降低湿度。子苗期严禁浇大水，应尽量延长光照时间，促进秧苗健壮。
3. 小苗期：控制灌水，促进根系发育
从第一片真叶顶心到3片真叶长出为小苗期。此阶段地上部生长量不大，但根系发育较快，必须满足根系发育的条件。应重点控制灌水，防止因浇水过多导致地温下降，影响根系生长。幼苗期植株需水量较少，适合浇小水。如果浇水过多，会造成土壤通气性差、缺少氧气、根系发育不良、植株生长纤弱，甚至出现大量死苗的现象。
4. 成苗期：保障充足水分，避免老化
3片真叶以后到定植为成苗期。成苗期生长量逐渐加大，根系发育旺盛，花芽及侧枝陆续分化，此时的水分必须充足。如果此阶段控水蹲苗，就会形成老化苗。成苗期要根据天气情况适当灌水，灌水后注意放风、松土。这一阶段也是花芽分化的关键时期，对缺水反应敏感，若床土缺水，幼苗生长容易受到抑制，形成老化苗，花芽分化减少，后期落蕾、落花、落果严重。陕西关中地区辣农总结的经验十分精辟：“早怕灌水，中怕旱，后期怕的大水灌”。
